Spremljanje epidemije SARS-CoV-2 v Sloveniji: 14. 10. 2024 – 27. 10. 2024

V stoenainpetdeseto (151.) presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 70 vzorcev (81% vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 14. 10. 2024 in 27. 10. 2024. Izmed teh je bilo 57 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 9 % iz Podravske regije, po 7 % iz Jugovzhodne ter Savinjske regije, 6 % iz Gorenjske regije, po 4 % iz Pomurske ter Zasavske regije, 3 % iz Goriške regije in po 1 % iz Koroške ter Primorsko-notranjske regije. Vzorcev oseb s stalnim prebivališčem v tujini ni bilo.

Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.

V stoenainpetdesetem presejalnem sekveniranju, ki zajema obdobje od 14. 10. 2024 do 27. 10. 2024, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.

Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v obdobju med 14. 10. 2024 in 27. 10. 2024. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu več ali enako 2 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij.

Agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji na spletu

Od julija 2024 je kot plod sodelovanja Nacionalnega inštituta za javno zdravje (NIJZ), Inštituta za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) ter Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) na spletu na voljo agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2, kjer se v realnem času zbirajo in osvežujejo podatki laboratorijev, ki izvajamo sekvenciranje. Na voljo je splošni pregled količine sekvenciranih vzorcev, dokazane različice in število VOC, VOI in VUM.

Povezava do spletnega mesta: Spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji